Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms