Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms