Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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