Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXD4L6Q3SYB3 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4L6Q3SYB3 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms