Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NIPAL4Q0D2K0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms