Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC01547P58512 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms