Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MIR4726-201ENST00000615971 58 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 AL731555.1-201ENST00000634547 1259 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NESP48681 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NESP48681 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NESP48681 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NESP48681 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NESP48681 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NESP48681 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 SLURP1-201ENST00000246515 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 OR2A14-201ENST00000408899 1012 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 MRPL45P2-201ENST00000425159 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 FLNC-AS1-201ENST00000469965 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 AC092745.1-201ENST00000535746 603 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 SLC16A7-209ENST00000549465 537 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 AC020909.3-201ENST00000598194 375 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 AL356423.1-201ENST00000604953 538 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NESP48681 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 PROP1-201ENST00000308304 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 S100B-202ENST00000367071 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 AC020893.2-201ENST00000506083 723 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 RN7SL238P-201ENST00000613832 290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 Metazoa_SRP.139-201ENST00000616096 290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 RN7SL106P-201ENST00000618104 290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 RETREG3-203ENST00000585894 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 NEK11-213ENST00000511262 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NESP48681 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 HTR3E-206ENST00000440596 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 ZNF816-201ENST00000270457 582 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 TBC1D21-201ENST00000300504 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 TUSC8-201ENST00000432701 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 AC046143.1-201ENST00000447139 972 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 AC110753.1-201ENST00000505711 1022 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 AC092368.1-201ENST00000568014 733 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 AC104423.1-201ENST00000591742 728 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 AC015802.4-203ENST00000592622 570 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 AC078880.3-201ENST00000603439 1121 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 AKTIP-201ENST00000300245 2133 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NESP48681 FOLR1-201ENST00000312293 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 FKBP1A-201ENST00000381715 705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 SEC11A-203ENST00000558134 971 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 AC013356.4-201ENST00000558421 482 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 FAM95B1-214ENST00000593216 759 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 CTBP2P7-201ENST00000593270 1244 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 FAM9A-201ENST00000381003 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms