Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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