Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9Y3F1 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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