Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms