Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms