Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ZNF816-201ENST00000270457 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 NRSN1-201ENST00000378475 800 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC092100.1-201ENST00000435148 702 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 FTLP16-201ENST00000446400 513 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC023157.1-201ENST00000453713 402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 CSRP1-219ENST00000533432 1149 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC130469.2-201ENST00000625112 1092 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 REG3A-201ENST00000305165 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 C1orf158-201ENST00000376210 695 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 MIR602-201ENST00000384960 98 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 WSB1-203ENST00000427287 1149 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC253536.1-201ENST00000437021 315 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ZNF415-221ENST00000600574 563 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AZU1P1-201ENST00000603479 385 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC064862.6-203ENST00000605139 691 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 OR4C3-202ENST00000611380 597 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 GH2-205ENST00000622506 702 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC023830.3-201ENST00000612995 1455 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ZNF114-201ENST00000315849 2206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AL353803.1-201ENST00000439014 800 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC046143.1-201ENST00000447139 972 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 MTND6P9-201ENST00000458075 519 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ZNF669-204ENST00000448299 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 TPT1-203ENST00000379056 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 TMEM18-203ENST00000405941 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 PLA2G6-213ENST00000447598 567 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC096713.1-201ENST00000514650 978 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 LINC02182-201ENST00000569362 498 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms