Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms