Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113Q902F9 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms