Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHDC9Q8NEP7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms