Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms