Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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SIX1Q15475 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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