Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms