Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms