Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms