Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOP2AP11388 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms