Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E5RI56 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E5RI56 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
E5RI56 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
E5RI56 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
E5RI56 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E5RI56 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E5RI56 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E5RI56 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
E5RI56 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
E5RI56 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
E5RI56 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E5RI56 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms