Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms