Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms