Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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