Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GGCXP38435 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GGCXP38435 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GGCXP38435 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GGCXP38435 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGCXP38435 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms