Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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CUL3Q13618 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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CUL3Q13618 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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CUL3Q13618 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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CUL3Q13618 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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CUL3Q13618 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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CUL3Q13618 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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