Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 LCMT2-201ENST00000305641 6957 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 GRM4-202ENST00000374181 7275 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms