Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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