Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMPOP42166 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMPOP42166 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMPOP42166 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms