Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms