Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC068134.4-201ENST00000613365 122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 MIR197-201ENST00000384976 75 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 VTI1BP2-201ENST00000394154 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 SWI5-204ENST00000419867 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC024580.2-201ENST00000623363 231 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDH10Q9P2E7 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms