Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms