Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B0

CCDC91, Coiled-coil domain-containing protein 91, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC91Q7Z6B0 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCDC91Q7Z6B0 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms