Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 OR2A5-201ENST00000408906 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 AC253536.5-201ENST00000506097 347 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 OR7E126P-201ENST00000526217 888 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 AZU1P1-201ENST00000603479 385 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 U62317.4-201ENST00000609758 448 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 AL139035.1-202ENST00000626308 565 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 AP000925.1-201ENST00000425960 1449 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 SPATA22-203ENST00000397168 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 AC015909.2-201ENST00000523083 547 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 KIAA1191-211ENST00000533553 560 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 KRTAP13-1-201ENST00000355459 749 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 AC092100.1-201ENST00000435148 702 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 ALOX12-AS1-209ENST00000575889 439 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 FAM173B-207ENST00000511437 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms