Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 GIMAP7-201ENST00000313543 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CAMK2BQ13554 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CAMK2BQ13554 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CAMK2BQ13554 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CAMK2BQ13554 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CAMK2BQ13554 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CAMK2BQ13554 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CAMK2BQ13554 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CAMK2BQ13554 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CAMK2BQ13554 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CAMK2BQ13554 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CAMK2BQ13554 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CAMK2BQ13554 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CAMK2BQ13554 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CAMK2BQ13554 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CAMK2BQ13554 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms