Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 FAM196A-201ENST00000424811 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 KCNV1-202ENST00000524391 6979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ADPRH-201ENST00000357003 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms