Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP8P40818 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP8P40818 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP8P40818 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP8P40818 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP8P40818 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP8P40818 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP8P40818 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP8P40818 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP8P40818 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP8P40818 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP8P40818 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP8P40818 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP8P40818 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms