Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms