Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4AP04350 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4AP04350 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4AP04350 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms