Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms