Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms