Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms