Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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