Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms