Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms