Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ZFHX2-AS1-201ENST00000553985 2322 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CCDC112-201ENST00000379611 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 2500 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 HIST1H2BH-201ENST00000619466 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms