Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 LINC02154-201ENST00000412485 1497 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC093072.1-201ENST00000589196 602 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 ADPGK-202ENST00000456471 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.68-201ENST00000612673 282 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC004554.2-201ENST00000634846 1893 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 HNRNPA1P68-201ENST00000425806 979 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 ZNF268-219ENST00000611984 583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms