Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP6P35125 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP6P35125 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP6P35125 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP6P35125 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP6P35125 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP6P35125 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP6P35125 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP6P35125 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms