Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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